La pollution bactérienne du carburant diesel est un problème très complexe et récemment de plus en plus courant.
Contrairement aux boues normales (paraffines, résidus de carbone et goudrons) qui sont éliminées par Fastol et réintégrées dans le combustible, les bactéries des boues ne sont solubles que dans les acides.
Une quantité minimale d'eau est suffisante pour favoriser le développement de ces bactéries.
Les résidus bactériens se présentent sous forme de mucilages, algues, moisissures et filaments et peuvent obstruer les filtres et les tuyaux en causant des dommages ou la défaillance du moteur.
Leur prolifération déclenche également des processus de corrosion dans le réservoir.